Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GFRA1P56159 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms