Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC13P55735 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC13P55735 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC13P55735 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC13P55735 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC13P55735 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC13P55735 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC13P55735 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC13P55735 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC13P55735 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC13P55735 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEC13P55735 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SEC13P55735 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SEC13P55735 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC13P55735 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC13P55735 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC13P55735 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC13P55735 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC13P55735 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC13P55735 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC13P55735 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC13P55735 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC13P55735 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC13P55735 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC13P55735 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC13P55735 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC13P55735 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC13P55735 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEC13P55735 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC13P55735 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEC13P55735 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC13P55735 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC13P55735 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC13P55735 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC13P55735 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC13P55735 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC13P55735 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC13P55735 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC13P55735 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC13P55735 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC13P55735 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC13P55735 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC13P55735 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC13P55735 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC13P55735 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC13P55735 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC13P55735 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC13P55735 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC13P55735 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC13P55735 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC13P55735 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC13P55735 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC13P55735 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC13P55735 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC13P55735 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC13P55735 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC13P55735 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC13P55735 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC13P55735 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC13P55735 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC13P55735 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms