Protein–RNA interactions for Protein: P55083

MFAP4, Microfibril-associated glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP4P55083 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MFAP4P55083 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms