Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP2P53365 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms