Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF135P52742 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF135P52742 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms