Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LUMP51884 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LUMP51884 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LUMP51884 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LUMP51884 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LUMP51884 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LUMP51884 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LUMP51884 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LUMP51884 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LUMP51884 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LUMP51884 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LUMP51884 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LUMP51884 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LUMP51884 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LUMP51884 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LUMP51884 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms