Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDR1P51861 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDR1P51861 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDR1P51861 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDR1P51861 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR1P51861 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR1P51861 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR1P51861 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR1P51861 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR1P51861 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR1P51861 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR1P51861 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR1P51861 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR1P51861 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR1P51861 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR1P51861 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR1P51861 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDR1P51861 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR1P51861 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR1P51861 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR1P51861 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR1P51861 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR1P51861 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR1P51861 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR1P51861 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR1P51861 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR1P51861 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR1P51861 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR1P51861 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR1P51861 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR1P51861 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR1P51861 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR1P51861 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR1P51861 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDR1P51861 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDR1P51861 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR1P51861 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR1P51861 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR1P51861 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR1P51861 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR1P51861 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR1P51861 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR1P51861 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR1P51861 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR1P51861 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR1P51861 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR1P51861 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR1P51861 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR1P51861 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR1P51861 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR1P51861 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR1P51861 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDR1P51861 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDR1P51861 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDR1P51861 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR1P51861 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR1P51861 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR1P51861 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR1P51861 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR1P51861 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR1P51861 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR1P51861 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR1P51861 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDR1P51861 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms