Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SMARCA2P51531 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SMARCA2P51531 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SMARCA2P51531 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms