Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB5CP51148 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms