Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAMP50895 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAMP50895 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAMP50895 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAMP50895 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAMP50895 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAMP50895 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAMP50895 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAMP50895 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAMP50895 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAMP50895 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAMP50895 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAMP50895 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAMP50895 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAMP50895 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAMP50895 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCAMP50895 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAMP50895 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAMP50895 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAMP50895 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAMP50895 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAMP50895 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAMP50895 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAMP50895 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAMP50895 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAMP50895 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAMP50895 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAMP50895 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAMP50895 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAMP50895 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCAMP50895 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAMP50895 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAMP50895 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAMP50895 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAMP50895 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAMP50895 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAMP50895 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAMP50895 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAMP50895 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAMP50895 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAMP50895 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAMP50895 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAMP50895 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCAMP50895 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAMP50895 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAMP50895 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAMP50895 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAMP50895 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAMP50895 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAMP50895 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAMP50895 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAMP50895 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAMP50895 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAMP50895 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCAMP50895 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCAMP50895 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCAMP50895 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCAMP50895 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCAMP50895 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BCAMP50895 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BCAMP50895 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BCAMP50895 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BCAMP50895 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCAMP50895 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAMP50895 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAMP50895 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAMP50895 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAMP50895 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAMP50895 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAMP50895 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAMP50895 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAMP50895 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAMP50895 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAMP50895 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAMP50895 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAMP50895 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAMP50895 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAMP50895 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAMP50895 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCAMP50895 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms