Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF6P49848 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF6P49848 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF6P49848 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF6P49848 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF6P49848 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF6P49848 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF6P49848 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF6P49848 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF6P49848 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF6P49848 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF6P49848 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF6P49848 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF6P49848 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF6P49848 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF6P49848 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF6P49848 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF6P49848 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF6P49848 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF6P49848 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF6P49848 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF6P49848 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF6P49848 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF6P49848 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF6P49848 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF6P49848 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF6P49848 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF6P49848 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF6P49848 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF6P49848 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF6P49848 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF6P49848 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF6P49848 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF6P49848 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF6P49848 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF6P49848 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF6P49848 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF6P49848 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF6P49848 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF6P49848 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF6P49848 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF6P49848 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF6P49848 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF6P49848 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.3 ms