Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNTAP49354 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNTAP49354 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNTAP49354 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FNTAP49354 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNTAP49354 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNTAP49354 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNTAP49354 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNTAP49354 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNTAP49354 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNTAP49354 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNTAP49354 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNTAP49354 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNTAP49354 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNTAP49354 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNTAP49354 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNTAP49354 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FNTAP49354 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FNTAP49354 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FNTAP49354 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FNTAP49354 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FNTAP49354 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FNTAP49354 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FNTAP49354 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FNTAP49354 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNTAP49354 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FNTAP49354 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNTAP49354 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FNTAP49354 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FNTAP49354 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNTAP49354 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNTAP49354 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNTAP49354 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNTAP49354 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNTAP49354 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNTAP49354 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNTAP49354 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNTAP49354 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FNTAP49354 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNTAP49354 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNTAP49354 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNTAP49354 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FNTAP49354 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNTAP49354 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNTAP49354 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNTAP49354 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNTAP49354 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNTAP49354 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNTAP49354 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNTAP49354 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNTAP49354 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNTAP49354 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FNTAP49354 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FNTAP49354 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTAP49354 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTAP49354 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTAP49354 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTAP49354 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTAP49354 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTAP49354 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTAP49354 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTAP49354 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FNTAP49354 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms