Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGM4P49221 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGM4P49221 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGM4P49221 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGM4P49221 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGM4P49221 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGM4P49221 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGM4P49221 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGM4P49221 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM4P49221 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM4P49221 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM4P49221 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM4P49221 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM4P49221 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM4P49221 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM4P49221 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM4P49221 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM4P49221 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM4P49221 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM4P49221 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM4P49221 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM4P49221 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM4P49221 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM4P49221 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM4P49221 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM4P49221 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM4P49221 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM4P49221 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM4P49221 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM4P49221 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM4P49221 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM4P49221 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM4P49221 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM4P49221 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM4P49221 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM4P49221 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM4P49221 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM4P49221 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM4P49221 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM4P49221 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM4P49221 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM4P49221 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms