Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI2P48788 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms