Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRIP1P48552 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRIP1P48552 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms