Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GRIA4P48058 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms