Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GALR1P47211 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GALR1P47211 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GALR1P47211 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GALR1P47211 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GALR1P47211 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GALR1P47211 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GALR1P47211 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GALR1P47211 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GALR1P47211 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GALR1P47211 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GALR1P47211 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GALR1P47211 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GALR1P47211 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GALR1P47211 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GALR1P47211 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GALR1P47211 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GALR1P47211 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GALR1P47211 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GALR1P47211 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GALR1P47211 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GALR1P47211 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GALR1P47211 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GALR1P47211 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GALR1P47211 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms