Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GNPDA1P46926 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GNPDA1P46926 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms