Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP13P45452 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP13P45452 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP13P45452 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP13P45452 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP13P45452 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MMP13P45452 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MMP13P45452 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MMP13P45452 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP13P45452 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP13P45452 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP13P45452 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP13P45452 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP13P45452 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP13P45452 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP13P45452 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP13P45452 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP13P45452 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP13P45452 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP13P45452 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP13P45452 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP13P45452 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP13P45452 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MMP13P45452 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP13P45452 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP13P45452 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms