Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGIRP43119 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGIRP43119 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGIRP43119 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGIRP43119 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGIRP43119 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGIRP43119 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGIRP43119 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGIRP43119 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGIRP43119 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGIRP43119 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGIRP43119 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGIRP43119 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTGIRP43119 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGIRP43119 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGIRP43119 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGIRP43119 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGIRP43119 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGIRP43119 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGIRP43119 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGIRP43119 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGIRP43119 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGIRP43119 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGIRP43119 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGIRP43119 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGIRP43119 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGIRP43119 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGIRP43119 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTGIRP43119 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGIRP43119 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGIRP43119 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGIRP43119 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGIRP43119 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGIRP43119 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGIRP43119 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGIRP43119 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGIRP43119 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGIRP43119 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGIRP43119 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGIRP43119 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGIRP43119 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGIRP43119 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGIRP43119 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGIRP43119 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGIRP43119 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGIRP43119 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGIRP43119 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGIRP43119 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGIRP43119 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGIRP43119 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGIRP43119 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms