Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4AP40617 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARL4AP40617 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARL4AP40617 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARL4AP40617 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARL4AP40617 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARL4AP40617 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4AP40617 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms