Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA7P36544 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms