Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP5C1P36542 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5C1P36542 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms