Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DSG3P32926 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG3P32926 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG3P32926 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG3P32926 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG3P32926 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG3P32926 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG3P32926 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG3P32926 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG3P32926 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG3P32926 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG3P32926 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG3P32926 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG3P32926 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG3P32926 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG3P32926 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG3P32926 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DSG3P32926 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG3P32926 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG3P32926 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG3P32926 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG3P32926 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG3P32926 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG3P32926 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG3P32926 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG3P32926 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG3P32926 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG3P32926 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG3P32926 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG3P32926 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG3P32926 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG3P32926 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG3P32926 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG3P32926 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSG3P32926 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG3P32926 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG3P32926 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG3P32926 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG3P32926 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG3P32926 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG3P32926 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG3P32926 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG3P32926 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG3P32926 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG3P32926 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG3P32926 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSG3P32926 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG3P32926 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG3P32926 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG3P32926 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG3P32926 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG3P32926 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG3P32926 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG3P32926 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG3P32926 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG3P32926 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG3P32926 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG3P32926 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG3P32926 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG3P32926 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSG3P32926 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSG3P32926 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG3P32926 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG3P32926 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG3P32926 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG3P32926 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG3P32926 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG3P32926 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG3P32926 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG3P32926 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG3P32926 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG3P32926 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG3P32926 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG3P32926 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG3P32926 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG3P32926 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG3P32926 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSG3P32926 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms