Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFNP31947 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFNP31947 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFNP31947 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFNP31947 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFNP31947 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFNP31947 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFNP31947 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFNP31947 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFNP31947 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SFNP31947 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SFNP31947 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFNP31947 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFNP31947 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFNP31947 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFNP31947 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFNP31947 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFNP31947 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFNP31947 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFNP31947 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SFNP31947 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFNP31947 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFNP31947 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFNP31947 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFNP31947 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFNP31947 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFNP31947 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFNP31947 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFNP31947 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFNP31947 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFNP31947 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFNP31947 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SFNP31947 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFNP31947 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFNP31947 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SFNP31947 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFNP31947 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFNP31947 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFNP31947 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFNP31947 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFNP31947 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SFNP31947 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SFNP31947 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFNP31947 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFNP31947 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFNP31947 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SFNP31947 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFNP31947 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFNP31947 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFNP31947 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFNP31947 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SFNP31947 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFNP31947 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFNP31947 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFNP31947 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFNP31947 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SFNP31947 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFNP31947 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFNP31947 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFNP31947 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFNP31947 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SFNP31947 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms