Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMOD1P29536 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMOD1P29536 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms