Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NMBRP28336 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NMBRP28336 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NMBRP28336 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NMBRP28336 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NMBRP28336 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NMBRP28336 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NMBRP28336 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NMBRP28336 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NMBRP28336 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NMBRP28336 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NMBRP28336 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NMBRP28336 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMBRP28336 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMBRP28336 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMBRP28336 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMBRP28336 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMBRP28336 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMBRP28336 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMBRP28336 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMBRP28336 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMBRP28336 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMBRP28336 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMBRP28336 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMBRP28336 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMBRP28336 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMBRP28336 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMBRP28336 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMBRP28336 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMBRP28336 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMBRP28336 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMBRP28336 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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