Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO2P25791 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO2P25791 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO2P25791 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO2P25791 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO2P25791 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO2P25791 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO2P25791 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO2P25791 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO2P25791 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO2P25791 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LMO2P25791 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMO2P25791 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMO2P25791 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LMO2P25791 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMO2P25791 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMO2P25791 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LMO2P25791 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LMO2P25791 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMO2P25791 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMO2P25791 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMO2P25791 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMO2P25791 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LMO2P25791 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMO2P25791 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMO2P25791 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMO2P25791 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMO2P25791 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMO2P25791 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMO2P25791 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMO2P25791 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMO2P25791 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMO2P25791 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMO2P25791 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LMO2P25791 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMO2P25791 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms