Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNE1P24864 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNE1P24864 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms