Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRGP23470 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRGP23470 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
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