Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNA2P20248 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms