Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNNI3P19429 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNNI3P19429 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNNI3P19429 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNNI3P19429 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNNI3P19429 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms