Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPN1P18031 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms