Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD44P16070 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD44P16070 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD44P16070 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD44P16070 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD44P16070 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD44P16070 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD44P16070 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD44P16070 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD44P16070 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD44P16070 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD44P16070 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD44P16070 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD44P16070 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD44P16070 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD44P16070 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD44P16070 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD44P16070 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD44P16070 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD44P16070 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD44P16070 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD44P16070 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD44P16070 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD44P16070 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD44P16070 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD44P16070 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD44P16070 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD44P16070 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD44P16070 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD44P16070 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD44P16070 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD44P16070 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD44P16070 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD44P16070 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD44P16070 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD44P16070 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD44P16070 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD44P16070 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD44P16070 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD44P16070 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD44P16070 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD44P16070 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD44P16070 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD44P16070 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD44P16070 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD44P16070 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD44P16070 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD44P16070 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD44P16070 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD44P16070 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD44P16070 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD44P16070 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD44P16070 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD44P16070 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD44P16070 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD44P16070 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms