Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GATA1P15976 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA1P15976 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA1P15976 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA1P15976 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms