Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRAFP15056 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRAFP15056 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRAFP15056 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRAFP15056 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRAFP15056 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRAFP15056 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRAFP15056 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRAFP15056 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRAFP15056 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BRAFP15056 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRAFP15056 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRAFP15056 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRAFP15056 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRAFP15056 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRAFP15056 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRAFP15056 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRAFP15056 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRAFP15056 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRAFP15056 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRAFP15056 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRAFP15056 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRAFP15056 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRAFP15056 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRAFP15056 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRAFP15056 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRAFP15056 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRAFP15056 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRAFP15056 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRAFP15056 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRAFP15056 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRAFP15056 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRAFP15056 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRAFP15056 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BRAFP15056 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRAFP15056 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRAFP15056 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRAFP15056 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRAFP15056 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRAFP15056 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRAFP15056 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRAFP15056 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRAFP15056 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRAFP15056 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRAFP15056 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRAFP15056 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRAFP15056 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRAFP15056 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRAFP15056 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRAFP15056 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRAFP15056 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRAFP15056 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRAFP15056 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRAFP15056 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRAFP15056 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms