Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-13P0DP09 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV1-13P0DP09 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms