Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf88P0DMB2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf88P0DMB2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms