Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM17P0DL12 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms