Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GIMD1P0DJR0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GIMD1P0DJR0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GIMD1P0DJR0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GIMD1P0DJR0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GIMD1P0DJR0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms