Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC2BP0DI82 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC2BP0DI82 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms