Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC166P0CW27 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms