Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM200BP0CF97 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM200BP0CF97 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms