Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC172P0C7W6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC172P0C7W6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms