Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA5P08648 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA5P08648 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms