Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-DOAP06340 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DOAP06340 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DOAP06340 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms