Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYBBP04839 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYBBP04839 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYBBP04839 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYBBP04839 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYBBP04839 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYBBP04839 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYBBP04839 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYBBP04839 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CYBBP04839 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CYBBP04839 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CYBBP04839 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYBBP04839 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYBBP04839 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYBBP04839 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYBBP04839 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYBBP04839 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYBBP04839 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYBBP04839 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYBBP04839 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYBBP04839 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYBBP04839 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYBBP04839 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYBBP04839 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYBBP04839 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CYBBP04839 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYBBP04839 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYBBP04839 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYBBP04839 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CYBBP04839 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYBBP04839 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYBBP04839 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYBBP04839 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYBBP04839 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYBBP04839 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYBBP04839 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYBBP04839 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CYBBP04839 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYBBP04839 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYBBP04839 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYBBP04839 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CYBBP04839 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYBBP04839 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYBBP04839 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYBBP04839 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYBBP04839 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CYBBP04839 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYBBP04839 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYBBP04839 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYBBP04839 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYBBP04839 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYBBP04839 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYBBP04839 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYBBP04839 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYBBP04839 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYBBP04839 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYBBP04839 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYBBP04839 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYBBP04839 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYBBP04839 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CYBBP04839 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYBBP04839 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYBBP04839 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYBBP04839 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms