Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTNP04004 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTNP04004 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTNP04004 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTNP04004 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VTNP04004 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTNP04004 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTNP04004 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTNP04004 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTNP04004 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTNP04004 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTNP04004 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTNP04004 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTNP04004 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTNP04004 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTNP04004 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTNP04004 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTNP04004 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTNP04004 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTNP04004 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTNP04004 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VTNP04004 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTNP04004 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTNP04004 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTNP04004 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTNP04004 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTNP04004 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTNP04004 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTNP04004 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VTNP04004 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTNP04004 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTNP04004 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTNP04004 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VTNP04004 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTNP04004 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTNP04004 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTNP04004 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTNP04004 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTNP04004 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTNP04004 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTNP04004 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTNP04004 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTNP04004 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTNP04004 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTNP04004 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTNP04004 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTNP04004 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VTNP04004 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VTNP04004 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTNP04004 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTNP04004 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTNP04004 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTNP04004 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTNP04004 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTNP04004 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTNP04004 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTNP04004 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTNP04004 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTNP04004 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTNP04004 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTNP04004 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTNP04004 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTNP04004 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VTNP04004 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTNP04004 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTNP04004 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTNP04004 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTNP04004 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTNP04004 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VTNP04004 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTNP04004 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTNP04004 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VTNP04004 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTNP04004 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VTNP04004 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTNP04004 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTNP04004 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms