Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLR1AO95602 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLR1AO95602 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms