Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF12O95522 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF12O95522 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms